绘制全球疫情实时地图的中国留学生

  美国约翰·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)发生的新的冠状肺炎流行的追踪图,全球平均每日点击量为10亿次。核心团队是两名年轻的中国年轻人和他们的年…

  美国约翰·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)发生的新的冠状肺炎流行的追踪图,全球平均每日点击量为10亿次。核心团队是两名年轻的中国年轻人和他们的年轻女导师。董恩生,今年30岁; 25岁的杜洪如,去年秋天进入约翰·霍普金斯大学的所有一年级博士生

  作为中国学生,董恩生和杜洪如比大多数美国科学家更早地担心新的王冠流行。专业敏感性和对流行信息的敏感性的叠加使他们意识到了更早地制作世界流行图的重要性和价值。

  美国东部时间5月7日,美国约翰·霍普金斯大学的流行追踪地图显示,全球确诊的新冠状病毒感染病例已超过375万,死亡人数已超过260,000;在美国,确诊病例的数量已超过122万,死亡人数已超过73,000。

  地图的背景是黑暗的,流行是血红色的。每个数字都是简单抽象的,每隔一刻钟更新一次,而且数字还会不断增大,这让人感到迷茫。他们沉重而刺痛的眼睛。

  由新的冠状病毒引起的死亡已发生超过260,000次,其中大多数是沉默而寂寞的。在垂死的病房里,病人看不见他的亲戚,死后没有葬礼,他的生活故事也不会在报纸上发表。大量的死亡就像一个黑洞,使死者失去了名字和面孔。

  但是,数字仍然很重要。这不仅对政府和公共卫生机构的决策者很重要,对于风险评估和流行趋势预测模型,社会人口学分析等领域的研究人员,以及对处于流行阴影下的所有人来说都非常重要。通过这种方式。

  该流行病地图仍在不断完善和完善,全球平均每日点击量为10亿次,最高的每日点击量达到45亿次。它是政府,研究人员和主流媒体最常引用的流行病数据来源。该流行病地图还导致产生了相似的流行病地图,并在美国各州和世界上许多国家/地区提高了数据准确性,从而提高了人们的知情权。

  在地图后面

  但是,直到最近才有很多人了解到,这个全球流行病追踪图的核心团队是两名年轻的中国人和他们的年轻导师。

  董恩生,今年30岁;杜洪如,今年25岁。他们都是去年秋天进入约翰·霍普金斯大学的一年级博士生。他们俩的名字都具有儒家文化。

  他们的导师叫劳伦·加德纳(Lauren Gardner),副教授,他只有35岁,具有建筑背景。去年在约翰·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)任教之前,她曾在澳大利亚悉尼的新南威尔士大学(UNSW)担任土木工程高级讲师。目前,她只从中国带来了这两名学生。

  他们的部门叫做土木工程与系统工程系,听起来并不像在对抗传染病和病毒学。但是什么也没有发生。

  董恩生说,这是世界上第一个实时更新的世界流行病地图。这个想法正式产生。从1月21日上午开始,他和他的导师在图书馆喝咖啡-这是老师和学生们聚会和交流的一种常规方式。两者都有相同的想法,“成功”。

  在与导师会面之前,他已经开始收集数据并做好准备,“这从一开始就是为了学术研究的目的,非常简单。”

  那天晚上,董恩生花了七八个小时来输入数据并制作跟踪图,直到凌晨三四点。经过审查,修改和其他程序后,讲师首次在东部时间22日在社交媒体Twitter上发布了该流行病的世界地图的第一版-恰逢武汉1月23日宣布“封闭城市”的时候,北京时间。

  董恩生说,一开始几乎没有现成的模板可以应用,他一直在输入数据和坐标。当数据被一张一张地呈现在世界地图上时,他逐渐意识到这是流行病地图的第一次,并在全球范围内实时更新。

  与您的教练一起喝咖啡,并在夜间火车上开车七个或八个小时,您可以开始一个世界第一。这么简单容易吗?

  在美国总统大选中,当政客们认可某位候选人时,有一种惯常的言论夸奖了这位候选人“为自己的一生做准备”。董恩生 杜红茹和杜红茹都还很年轻,但是从他们的学习和工作经验来看,这句话确实可以适用。

  董恩生说,他毕业于重庆西南大学地理系,2012年赴美国求学。获得硕士学位后,先后在美国地方政府的IT和卫生部门实习,从事软件工作。公司,电力公司和电信公司。

  他已经接受了地理和统计方面的正规学术培训。他目前的研究领域包括网络科学,移动性建模,机器学习,空间分析和可视化以及传染病的跨学科研究。在新的王冠流行病爆发之前,他曾参与预测美国和太平洋岛国和地区的麻疹风险以及斯里兰卡的登革热风险。

  杜鸿儒也具有跨学科背景。他是2017年天津大学化学工程学院的毕业生。他曾在英国爱丁堡大学学习化学材料科学,并在威斯康星大学麦迪逊分校学习工业工程和运营研究。

  他擅长数学模型和路径优化,主要研究方向包括流行性大数据处理,网络优化和数学建模,以研究和预测全球流行病的发展。他于2月1日加入流行病地图小组,并由他编写了自动数据更新代码。

  他说,您也可以想象病毒是作为一种网络传播的,州和县是网络节点,每个节点之间的人口流动构成了一种联系。无论是通过数学模型预测流行趋势还是进行人口统计学社会学分析,系统科学都非常重要。

  作为中国学生,董恩生和杜洪如比大多数美国科学家更早地担心新的王冠流行。正是专业知识和对流行病信息的敏感性的叠加使他们意识到了更早地制作世界流行病地图的重要性和价值。先前的学术训练和经验积累也使他们不仅能够在指导老师的指导下“思考”,而且当然也能“做到”。

  但是“做”并不比“思考”容易。从1月下旬到现在,董恩生和杜洪如为疫情地图的升级,完善和维护付出了大量的努力和劳动,并对疫情数据进行了相关研究。

  在手动输入阶段,他们每天必须工作约10个小时。 3月中旬,当切换到全自动数据更新时,每天的工作量达到15或6个小时,导师也一直与他们合作,直到凌晨3或4时为止。即使在将团队扩大到约50人并自动实时更新数据之后,每天也要花费五到六个小时来检查和更正数据,最多需要十个小时。

  魔鬼通常隐藏在细节中。 4月13日,约翰霍普金斯大学新皇冠流行病统计网站创建了一个乌龙事件,并错误地报告了全球确诊病例超过200万。原因是在佛罗里达州的实际案例数21019被错误地输入为123019。,导致了100,000多个错误案例。但不久之后,他们将数字重新调整为190万。

  在维护流行病地图时,检查数据以确保准确性是重要的部分。杜洪如说,由于美国疾病预防控制中心的数据滞后,他们主要依靠捕获美国当地媒体报道的数据以及Twitter上各州卫生官员的报道。其他国家和地区的流行病基于Worldometers和本地媒体等网站。由于更新时间早于官方数据,因此在计算机自​​动更新的第二天,团队将使用州疾病预防控制中心的数据检查美国流行数据,而其他国家和地区的数据将使用官方CDC的数据进行检查。世界卫生组织。

  董恩生说,为了保证数据的准确性,他们还采取了四项措施。一种是保留原始数据记录,每次更新都有一个追溯记录,第二种是汇总时间序列表,第三种是列出所有更正记录,第四种是组织手动验证。

  值得一提的是,在约翰霍普金斯大学流行病世界地图的背后,仍然有更多的中国年轻人活跃。

  据董恩生和杜洪如介绍,操作团队目前约有50人,其中数据验证团队的志愿者主要是来自不同国家的中国学生。 部门。中国提供的流行病数据为国际研究做出了不可磨灭的贡献。对新的王冠流行病的反应,中国跨学科国际传染病研究的发展,全球公共卫生参与的加强以及政府部门和研究机构对流行病数据的可视化和国际化的改善都提供了新的机遇。

  站出来

  董恩生和杜洪如认为,约翰·霍普金斯大学流行病地图由于多种因素而脱颖而出,并结合以下八个主要原因:

  首先,它起步较早,比世界其他地区领先一步。与后来出现的其他流行病地图相比,数据更准确,更快。其次,它在流行病学方面更专业,而美国的流行病在县一级是准确的。第三是映射中显示的专业精神;第四是公开透明的数据,所有数据均上载到GitHub,为全球所有政府决策部门和科学研究人员提供开源数据。第五是确保及时更新,用户参与度很高。德国,法国和意大利等非英语国家的许多用户将积极向他们报告当地媒体报道的最新流行情况,其速度要比等待官方渠道确认的速度快得多;第六,流行病地图的设计,黑色和红色之间的高对比度构成了强烈的视觉冲击。第七,约翰·霍普金斯大学在全球医学和公共卫生领域享有很高的声誉,这使得普通大学从一开始就很难掌握该流行病地图。通过学校的声誉获得的权威;第八,从最初的导师的Twitter到各国媒体的报道,社交网络和媒体传播的滚雪球效应产生了。

  从日内瓦的世界卫生组织总部,到纽约的联合国总部和华盛顿的白宫,流行病会议,甚至《纽约时报》和其他美国主流媒体,大多数都使用他们的统计数据。

  但是,董恩生特别指出,疫情图和疫情数据不能完全反映一个国家抗击疫情的能力。目前,国际社会缺乏关于流行病报告的全球指导文件,也没有统一的报告标准。不同国家和地区的统计口径不同,病毒检测水平不同,人们对这一流行病的看法也不同。

  在欧洲和美国,统计上也有许多混淆,缺乏和重叠的地方。例如,美国监狱系统分为联邦监狱和地方监狱。尚不知道每个州和县的统计数据中是否包括联邦监狱的流行病。由于囚犯的隐私和相关法律的限制,许多地方都不愿宣布监狱流行。在州与县之间的边界地区,出院或转移的患者经常是州际的,如何计数也是一个问题。此外,考虑到重复计算的可能性,美国的流行病尚未列入流行病地图。

  在世界上,有时存在一个“数据参考周期”,即相关网站的数据可能来自约翰·霍普金斯大学的流行病地图,因此需要仔细筛选以不断提高直接获取数据的能力。

  董恩生认为,尽管美国疫情很严重,但从科学研究和大数据创新的角度来看,许多做法还是值得学习的。

  例如,对各种流行病预测模型的分析层出不穷,相关的研究可以描述为“八个仙人过海,每个人都展现出其魔力”。无论对于学术界还是公众,这种数学模型分析都是非政治性的。无论预测是对还是错,它都可以为讨论公共卫生对策创造空间,并孕育出许多新的观点和对策。

  追求具有杰出的“跨行业”特征的多学科情报的集成。在美国,可以跨专业选择本科课程。在美国,获得理学硕士学位和攻读工程学博士学位(例如董恩生)的情况并不罕见。为了避免只显示流行病地图,这恰好是地理,计算机和疾病传播的学术背景。

  实际上,约翰·霍普金斯大学系统科学与工程中心于去年更名。该计划本身突出了“跨界”色彩。董恩生说,系统工程本身属于 美国的一个新领域。除疾病传播外,它还与公共卫生学院和美国医院系统合作开展了多个项目,包括CT扫描和人工智能。

  另外,在科学研究领域中,没有关于资历的讨论,因此有能力的人可以相对平稳地脱颖而出。这对于营造科学研究和创新氛围也非常重要。董恩生,杜洪如和他们的导师加德纳都是去年进入约翰·霍普金斯大学的年轻“新人”。他们迅速发布的流行病地图在资金,服务器维护,图书馆资源和运营团队建设方面得到了学校的支持。

  约翰·霍普金斯大学(Johns Hopkins University)在全球公共卫生领域的声誉无疑为他们提供了一个卓越的平台,但是他们作为“新血液”带来的活力,活力和活力反过来又为学校品牌增添了金子。

  董恩生和杜洪如都钦佩导师加德纳副教授,并称赞他们。根据他们的说法,这位年轻的女导师经常在凌晨两三点上班,审查和指导学生的工作,处理错误反馈电子邮件,与有关方面协调,并向政府和国会报告…尽管她有高凭借其学术热情和专业敏锐度,加德纳不会抹杀学生的工作和贡献,不会为学生提供很多机会,并且会关注帮助和保护学生。

  更值得称赞的是,它们“非常有原则”,坚持数据公开,并拒绝将流行病地图商业化。美国一些一流的大公司提供高额资金和慷慨的合作条件,这似乎是“双赢”的,但团队仍然拒绝,坚持公开共享,反对过度的业务联系。正是这一原理使约翰·霍普金斯大学的流行病追踪图获得了更广泛的公众影响。

  五月转眼间。今天,约翰·霍普金斯大学的流行病追踪图已经升级到多个版本,并且数据分类更加丰富和详细。在世界流行地图上,不仅在180多个国家和地区有确诊病例数,而且在每个州和省都有确诊病例数。除了已确诊病例的累计数量外,还存在尚未康复的患者数量,发病率和已确诊病例的数量。死亡率,检出率和住院率等重要数据。在美国流行病地图中,不仅每个州的确诊病例数,人口比例和致死率,而且还有确诊病例数最高的50个县和排名最高的20个县的排名。死亡人数最高。

  此外,还有一个特殊部分来分析一系列重要数据,以确定流行病的传播范围,包括美国各州流行病的种族分布;全球确诊病例数和每10万人死亡人数的比较;世界上最严重的10种流行病在国家/地区中,有关确定流行曲线如何趋平的新病例的每日数据等。

  杜洪如说,可靠的数据是研究和决策的基础。从约翰·霍普金斯大学流行追踪地图获得的大量访问表明,人们对可靠和客观的信息有巨大的需求。随着流行病地图的影响扩展,他感到压力更大,并且在数据更新和验证方面更加谨慎。这是世界面临的重大公共卫生事件。流行病地图的意义超出了学术研究本身。

  董恩生说,自爆发以来,他一直在忙于更新数据和更新流行病地图,“忘记了生活是什么样的”。 “对我来说,工作从未停止过。工作越来越重。有时,当我突然抬头看时,流行病就在我身边。世界真的在变化如此之快。”

  青年流行病,我相信董恩生和杜宏儒都将令人难忘。这种流行病最终将过去,世界变化的步伐不会减慢。我希望两个中国年轻人能走得更远。 (记者徐建梅)

作者: 网站编辑

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